層流凈化工作臺為產品或樣品提供了工作空間，可保護其免受微生物等微粒污染。這是通過HEPA過濾器的潔凈空氣層流實現的，該空氣經過工作區吹向用戶和實驗室。因此，基本的層流凈化工作臺無法為用戶提供保護，使其免受化學危險或傳染性物質（包括微粒或揮發性危險物以及氣溶膠）的侵害。這種保護需要生物安全柜（在下面討論）。

層流清潔臺分為垂直和水平兩種，根據使用方式的不同，它們具有不同的優勢。垂直層流潔凈工作臺力跨越工作空間的HEPA過濾空氣向下，并且是用于部件或裝置組件，電子檢測，殼體的加工設備，藥物制備，或制備媒體有用的，例如。水平層流凈化工作臺的工作空間沐浴在經過HEPA過濾的水平層流中，通常用于臨床或制藥應用，或需要無菌，無顆粒的環境。

矛盾的是，將物體（例如盛有標本的容器）放置在層流通風櫥內時，會觸發氣流變化，從而可能污染層流潔凈工作臺工作空間。即使是將手伸入層流中的簡單動作（例如操縱樣本，甚至只是將樣本放置在工作空間中），也會干擾氣流。這些事件被稱為障礙物，會導致氣流紊流，從而導致臟空氣從實驗室進入（稱為反沖洗），并且顆粒數量急劇上升。某些層流罩具有特殊設計，可zui大程度地減少反沖洗。例如，沿著通風櫥工作空間邊緣的狹槽可以充當高速空氣回流，從而減少了在阻塞期間將臟空氣引入層流通風櫥中。